免費試用！智慧芽上線全球首個通式序列比對算法，檢索專利中隱藏的“萬億序列”的通式序列

#本文僅代表作者觀點，不代表IPRdaily立場#

“首家向用戶開放免費注冊的生物序列商業數據庫?！?/strong>

來源：IPRdaily中文網（iprdaily.cn）

引言

FTO（Freedom to Operate）專利檢索與分析是醫藥企業評估專利侵權風險的有效手段，充分掌握并實施FTO專利檢索與分析有助于醫藥企業更好地降低風險、減少損失。在進行FTO調查的過程中，檢索數據庫的選擇至關重要。FTO檢索是查全性檢索，如果選擇的數據庫檢索不全面，就會增加一定的侵權風險，因此保證檢索式命中結果的全面性和準確性，至關重要。

在生物醫藥領域FTO專利檢索中，除了利用專利數據庫構建檢索式外，對于生物序列的檢索，還要使用特定的生物序列檢索工具進行檢索。

2023年6月，智慧芽旗下生物序列數據庫（簡稱"Bio"）重磅上線全球首個通式序列比對算法，檢索專利中隱藏的“萬億序列”的通式序列。同年10月，Bio免費版正式上線并開放注冊。

現在掃碼立即搶先免費體驗！

一、通式序列檢索輻射萬億序列

背景：專利撰寫人員會在序列中引入簡并符、通配符和運算符等信息，并通過大段解釋性文檔描述這些符號的具體參數。通式序列并不具備生物學意義，它主要用于擴展專利的保護范圍并設置搜索障礙。傳統的序列同源性比對算法并沒有考慮到這種通式序列的情況，因此使用傳統算法進行搜索存在漏檢風險，無法找出所有潛在目標序列。

根據智慧芽生物序列數據庫統計顯示，在全球專利文獻中，這種特殊的通式序列數量并不低：核酸約740萬條，占總核酸數的7.12%；蛋白序列131萬條，占總蛋白序列數的7.55%。這表明大量的通式序列，由于特殊符號的存在，會對檢索結果產生影響，對于序列FTO來說風險非常高。

例如，查詢序列

"EVGSYPAPSDACPSDYFYCDASGRSAGGGGTENLYFQGSGGS"，

在命中目標序列時，

"EVGSYXXXXX XCXXXXXXCX XSGRSAGGGG TENLYFQGSG GS"。

使用傳統序列方式檢索，BLAST算法的相似度僅為67%，但實際上相似度為100%。這種生物序列通過常規算法搜索會導致兩種情況：要么序列無法搜索，要么由于相似度低于閾值而被排除在結果之外。無論哪種情況，都會給序列搜索人員帶來不便，無法方便地與權利要求進行同源性比較，甚至會漏檢關鍵序列信息。

為了解決通式序列帶來的漏檢風險，智慧芽算法工程團隊利用自研的NLP、CV、實體識別、指代消解等技術，構建了深度學習模型，用于識別和解析序列表和專利全文中的通式序列及其取代信息，并建立了通式序列檢索庫。

圖：智慧芽生物序列數據庫通式序列檢索入口

該庫通過特殊的序列比對算法，在通式序列檢索時不僅能夠搜索這類序列，還能返回真實的相似度。智慧芽的通式序列檢索解決方案能夠進一步降低在專利FTO和查新工作中的漏檢風險。

圖：智慧芽生物序列數據庫通式序列檢索示意

二、Bio免費版全面開放注冊

常見的公共免費序列檢索數據庫，往往存在專利數據收錄不全、算法以及保密等問題，不適合用于嚴謹的防侵權分析。所以，在進行FTO專利檢索與分析時，常選擇數據收錄和算法均能滿足防侵權分析的商業數據庫進行序列檢索。智慧芽Bio作為主流商業數據庫之一，今年10月重磅宣布免費版正式上線并開放注冊。歡迎新老用戶掃碼注冊使用！

無論您是致力于開發新型癌癥治療方法的生物科學家，希望了解可能影響藥物反應的不同序列變異，還是需要進行成果序列可專利性分析及FTO工作的知識產權律師，智慧芽生物序列數據庫均是幫助您解鎖和理解復雜生物序列的重要工具。

免費版權限：常規搜索、短序列搜索、Motif搜索各5次、可使用變異過濾查看變異報告、可查看來自序列索引專利、序列索引公開庫、人工標注序列的50條序列詳情。

免費版申請及使用入口：bio.zhihuiya.com

數據全面準確：智慧芽生物序列數據庫收錄海量全球生物序列相關數據，并基于AI與人工標注數據，高效保障準確性，滿足用戶的序列檢索分析需求。

功能豐富：

功能：通式檢索、常規檢索、短序列檢索、Motif搜索、片段搜索、組合檢索、抗體搜索、藥物/基因索引

工具：序列助手、序列比對、工作空間、郵件提醒、sequence_suite、高級設置、過濾篩選

圖：智慧芽生物序列數據庫功能

圖：抗體檢索結果

圖：序列助手示意圖

檢索清晰便捷：檢索簡單易上手，界面友好，數據庫部分界面截圖如下：

現在掃碼立即搶先免費體驗！

為了提升您的檢索體驗
電腦端請訪問生物序列數據庫官網

bio.zhihuiya.com

生物序列專利檢索場景案例

CAR-T領域有哪些檢索方式能找到更多更全的技術資料和專利信息

知道一個抗體的名字，如何找到他對應的序列信息？

ADC藥物專利檢索分析策略

（原標題：智慧芽生物序列數據庫「通式序列+免費版」王炸組合等你來?。?br/>

來源：IPRdaily中文網（iprdaily.cn）

編輯：IPRdaily辛夷          校對：IPRdaily縱橫君

注：原文鏈接：免費試用！智慧芽上線全球首個通式序列比對算法，檢索專利中隱藏的“萬億序列”的通式序列（點擊標題查看原文）

「關于IPRdaily」

IPRdaily是全球領先的知識產權綜合信息服務提供商，致力于連接全球知識產權與科技創新人才。匯聚了來自于中國、美國、歐洲、俄羅斯、以色列、澳大利亞、新加坡、日本、韓國等15個國家和地區的高科技公司及成長型科技企業的管理者及科技研發或知識產權負責人，還有來自政府、律師及代理事務所、研發或服務機構的全球近100萬用戶（國內70余萬+海外近30萬），2019年全年全網頁面瀏覽量已經突破過億次傳播。

（英文官網：iprdaily.com  中文官網：iprdaily.cn） 

本文來自IPRdaily中文網（iprdaily.cn）并經IPRdaily.cn中文網編輯。轉載此文章須經權利人同意，并附上出處與作者信息。文章不代表IPRdaily.cn立場，如若轉載，請注明出處：“http://www.meihaolucy.com”